MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 chromosome

Total Repeats: 82712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009706	ATA	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
2	NC_009706	ACT	2	6	58	63	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952671
3	NC_009706	AATA	2	8	169	176	75 %	25 %	0 %	0 %	153952671
4	NC_009706	TAA	2	6	185	190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
5	NC_009706	GAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952671
6	NC_009706	AAT	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
7	NC_009706	TGA	2	6	321	326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952671
8	NC_009706	GTAACA	2	12	377	388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153952671
9	NC_009706	GCA	2	6	400	405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153952671
10	NC_009706	TTTA	2	8	447	454	25 %	75 %	0 %	0 %	153952671
11	NC_009706	TA	3	6	453	458	50 %	50 %	0 %	0 %	153952671
12	NC_009706	ATA	3	9	518	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
13	NC_009706	AGT	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952671
14	NC_009706	TCT	2	6	550	555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153952671
15	NC_009706	TAA	2	6	575	580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
16	NC_009706	GAT	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952671
17	NC_009706	GAT	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952671
18	NC_009706	AAAG	2	8	673	680	75 %	0 %	25 %	0 %	153952671
19	NC_009706	GAA	2	6	688	693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952671
20	NC_009706	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	153952671
21	NC_009706	AACA	2	8	727	734	75 %	0 %	0 %	25 %	153952671
22	NC_009706	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
23	NC_009706	A	6	6	864	869	100 %	0 %	0 %	0 %	153952671
24	NC_009706	CATA	2	8	914	921	50 %	25 %	0 %	25 %	153952671
25	NC_009706	CAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153952671
26	NC_009706	AAATC	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	153952671
27	NC_009706	TAA	2	6	965	970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
28	NC_009706	TCA	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952671
29	NC_009706	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
30	NC_009706	GTA	2	6	1093	1098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952671
31	NC_009706	TAT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952671
32	NC_009706	ATC	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952671
33	NC_009706	GAA	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952671
34	NC_009706	CA	3	6	1249	1254	50 %	0 %	0 %	50 %	153952671
35	NC_009706	AAT	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952671
36	NC_009706	A	7	7	1293	1299	100 %	0 %	0 %	0 %	153952671
37	NC_009706	CTAA	2	8	1330	1337	50 %	25 %	0 %	25 %	153952671
38	NC_009706	CAA	2	6	1348	1353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153952671
39	NC_009706	ATT	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952671
40	NC_009706	A	6	6	1632	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	153952672
41	NC_009706	TAA	2	6	1772	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
42	NC_009706	AAG	3	9	1799	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952672
43	NC_009706	ATA	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
44	NC_009706	TA	5	10	1869	1878	50 %	50 %	0 %	0 %	153952672
45	NC_009706	ATT	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952672
46	NC_009706	AGA	2	6	1950	1955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952672
47	NC_009706	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	153952672
48	NC_009706	T	7	7	1990	1996	0 %	100 %	0 %	0 %	153952672
49	NC_009706	A	6	6	2016	2021	100 %	0 %	0 %	0 %	153952672
50	NC_009706	TATTT	2	10	2082	2091	20 %	80 %	0 %	0 %	153952672
51	NC_009706	TAAAAA	2	12	2097	2108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153952672
52	NC_009706	TAA	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
53	NC_009706	GAT	3	9	2230	2238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952672
54	NC_009706	ATT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952672
55	NC_009706	TAA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
56	NC_009706	A	7	7	2383	2389	100 %	0 %	0 %	0 %	153952672
57	NC_009706	TTG	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153952672
58	NC_009706	TAA	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
59	NC_009706	AAT	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
60	NC_009706	AT	3	6	2528	2533	50 %	50 %	0 %	0 %	153952672
61	NC_009706	TAT	2	6	2649	2654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952672
62	NC_009706	A	6	6	2655	2660	100 %	0 %	0 %	0 %	153952672
63	NC_009706	A	8	8	2665	2672	100 %	0 %	0 %	0 %	153952672
64	NC_009706	AAT	2	6	2710	2715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952672
65	NC_009706	AAATTA	2	12	2753	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952673
66	NC_009706	T	6	6	2790	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	153952673
67	NC_009706	ATGGT	2	10	2849	2858	20 %	40 %	40 %	0 %	153952673
68	NC_009706	AGG	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153952673
69	NC_009706	TA	3	6	2911	2916	50 %	50 %	0 %	0 %	153952673
70	NC_009706	TA	3	6	3036	3041	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
71	NC_009706	AT	3	6	3109	3114	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
72	NC_009706	AT	3	6	3145	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
73	NC_009706	GTAT	2	8	3157	3164	25 %	50 %	25 %	0 %	153952674
74	NC_009706	GCA	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153952674
75	NC_009706	CAAG	2	8	3193	3200	50 %	0 %	25 %	25 %	153952674
76	NC_009706	TAA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952674
77	NC_009706	CATA	2	8	3235	3242	50 %	25 %	0 %	25 %	153952674
78	NC_009706	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952674
79	NC_009706	A	7	7	3273	3279	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
80	NC_009706	A	6	6	3306	3311	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
81	NC_009706	AATA	2	8	3314	3321	75 %	25 %	0 %	0 %	153952674
82	NC_009706	AGTA	2	8	3335	3342	50 %	25 %	25 %	0 %	153952674
83	NC_009706	ATA	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952674
84	NC_009706	AGA	2	6	3426	3431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952674
85	NC_009706	A	6	6	3465	3470	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
86	NC_009706	TAT	3	9	3471	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952674
87	NC_009706	ATA	2	6	3493	3498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952674
88	NC_009706	ATT	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952674
89	NC_009706	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
90	NC_009706	TA	3	6	3549	3554	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
91	NC_009706	TTC	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153952674
92	NC_009706	TAA	2	6	3604	3609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952674
93	NC_009706	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952674
94	NC_009706	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
95	NC_009706	AT	3	6	3701	3706	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
96	NC_009706	ATA	2	6	3727	3732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952674
97	NC_009706	AGA	2	6	3734	3739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952674
98	NC_009706	A	7	7	3770	3776	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
99	NC_009706	AT	4	8	3778	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
100	NC_009706	GAT	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952674
101	NC_009706	ATA	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952674
102	NC_009706	AT	4	8	3998	4005	50 %	50 %	0 %	0 %	153952674
103	NC_009706	TGA	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952674
104	NC_009706	A	8	8	4061	4068	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
105	NC_009706	ATT	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952674
106	NC_009706	A	7	7	4100	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	153952674
107	NC_009706	AATTT	2	10	4121	4130	40 %	60 %	0 %	0 %	153952674
108	NC_009706	GTT	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153952675
109	NC_009706	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952675
110	NC_009706	TAT	2	6	4311	4316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952675
111	NC_009706	TAAA	2	8	4325	4332	75 %	25 %	0 %	0 %	153952675
112	NC_009706	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	153952675
113	NC_009706	TAC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952675
114	NC_009706	A	8	8	4442	4449	100 %	0 %	0 %	0 %	153952676
115	NC_009706	ATG	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
116	NC_009706	GTAT	2	8	4514	4521	25 %	50 %	25 %	0 %	153952676
117	NC_009706	TCA	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952676
118	NC_009706	TAG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
119	NC_009706	ATA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952676
120	NC_009706	TGA	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
121	NC_009706	ATAAA	2	10	4691	4700	80 %	20 %	0 %	0 %	153952676
122	NC_009706	TAA	2	6	4718	4723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952676
123	NC_009706	TAC	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952676
124	NC_009706	GGT	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153952676
125	NC_009706	GTA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
126	NC_009706	TGAAGT	2	12	4830	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
127	NC_009706	AG	3	6	4877	4882	50 %	0 %	50 %	0 %	153952676
128	NC_009706	ATA	2	6	4906	4911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952676
129	NC_009706	GAA	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952676
130	NC_009706	AT	3	6	4939	4944	50 %	50 %	0 %	0 %	153952676
131	NC_009706	TGA	2	6	4968	4973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952676
132	NC_009706	TAAA	2	8	5027	5034	75 %	25 %	0 %	0 %	153952676
133	NC_009706	AAG	2	6	5061	5066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952676
134	NC_009706	AGA	2	6	5073	5078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952676
135	NC_009706	ATT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952676
136	NC_009706	AGG	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153952676
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138	NC_009706	AAAC	2	8	5134	5141	75 %	0 %	0 %	25 %	153952676
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